顺应潮流：仅血浆ctDNA-MRD测定的应用前景！

"甲基转化成被纳入MRD检验的潜力是完全一致的，渴望这些进展将之后提升新世代MRD检验的机动性。"

癌症的MRD检验是一种能用且特异的用于追踪癌症症状血液里源性真核细胞（如ctDNA）相对于数量的步骤。在这种状态下，症状没有肉眼可见的鳞状，但确实发挥作用标准规范诊断扫描步骤不能检验到但再一就会导致癌症发作的细凝鳞状。

MRD，常会称为细凝残留鳞状（Minimal Residual Disease）。应用于于“Minimal” （细凝）这个词语，是因为它在文献和诊断科精研家里非常会常会用。不过，“Minimal”这个词语有可能不具备“说服力”，因为除此以外的病变在病症和病患决策者方面也有可能不具备极为重要意义。“Measurable”（可精确测量）一词语可非常会准确地阐述残留在病人体内的癌细胞的发挥作用。NCCN指南同时应用于于了“Minimal Residual Disease”（细凝残留鳞状）和“Measurable Residual Disease”（可精确测量残留鳞状）两个术语。

此之外，可行性分析表明在分子结构技术水平上检验多种癌症特点的ctDNA比如说不具备诊断好处，文献和诊断科精研家有时也就会应用于于“Molecular Residual Disease”（分子结构残留鳞状）一词语。

近十年，国内之外在也就是说里基于ctDNA的MRD评核（ctDNA-MRD）的诊断原始数据和论据更为多，重启了也就是说瘤MRD检验的潮流。也就是说瘤ctDNA-MRD检验的技术开发道家主要有两大类：

1）Tumor-informed assays（知情归纳）

对原发有分组织顺利完成高通量以解剖症状的特异原核生物变异图谱，然后设计亚硫酸盐内置panel或应用于于通常会panel顺利完成个性转化成的ctDNA检验归纳。

2）Tumor-uninformed assays（不知情归纳）

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays，即无需原发有分组织，仅仅举例来说一分组自行选定亚硫酸盐/核酸设计的与癌症特点涉及的通常会panel顺利完成ctDNA检验归纳，常会在检验ctDNA选项性的同时，都以ctDNA甲基转化成或片段分组精研等多分组精研步骤。弥补了有分组织结果显示太低或追踪位点太低或TAT过长等问题。

Tumor-informed assays的技术开发手段非常会具备大众的思维，在保证更高选项性的此前提下，可通过追踪多位点的sample-level（结果显示技术水平）颇更高其精确度，技术开发投票率值得注意不是相当多更高。Tumor-uninformed assays的技术开发手段非常会类似于早筛，通过提升site-level（位点技术水平）检验精确度并都以ctDNA甲基转化成或片段分组精研并转转化成机器精研习算法颇更高其精确度和选项性，技术开发投票率值得注意较更高。

2021年4同月29日，《Clinical Cancer Research》Skype发表了“仅仅应用于于血液ctDNA检验结腺癌症状细凝残留鳞状（MRD）”的文章，首次公开了Guardant Reveal的分析原始数据：MRD检验精确度远超到91%，选项性远超100%，这些发现支持了仅仅血液ctDNA-MRD检验（Tumor-uninformed assays）的潜在诊断应用于。

2021年8同月13日，《Clinical Cancer Research》Skype发表了“顺应潮流：仅仅血液ctDNA-MRD检验的应用于此前景”的文章，在这里分析者们讨论评核了仅仅血液ctDNA检验MRD的控制能力，以及将甲基转化成整合到ctDNA检验的潜在好处。2

Parikh及其同僚1 和Taieb及其同僚3 讨论了仅仅血液ctDNA-MRD检验在结腺癌（CRC）症状里的潜在诊断应用于。

▲ ctDNA甲基转化成和选项性在两项分析里的应用于来得（Parikh和Taieb）

结腺癌（CRC）的病患仍然面临着一个挑战，即相当多的CRC症状因中期疾病发作而过早失踪。尽管诊断采用了标准规范的除此以外病患，但更预防性IIIC期CRC症状的5年生存率也仅仅有53%，究其原因是没有发现扫描精研上未能检验到的细凝残留鳞状（MRD）。4

在此之此前，仍迫切并不需要准确确认哪些症状术后发挥作用MRD，以帮助导师减少或增加除此以外病患，并增加皮肤病的更有利于，同时并能地减少可能会病患的涉及毒性。

在过去的几年里，我们对ctDNA在CRC诊断和病症里的应用于有了广泛的了解。在此之此前，基于ctDNA的MRD评核正广泛应用于于癌症的病患里。

ctDNA是由DNA的短片段分组成（大约130-150bp），由癌细胞通过凋亡、坏死或分泌释放到循环系统里。 ctDNA的半衰期较宽致使其成为敏感的实时负荷一个大，它的发挥作用有可能反映了扫描精研上看得见的凝转移。

在皮肤病性病患结束后，ctDNA里消失的体细胞选项性对随后的扫描精研发作不具备较更高的阳性预见价值，相当多是当这些选项性与手术的有分组织里的选项性相关联时。检验这种ctDNA下定义的MRD可以在I-III期CRC里提此前扫描精研数同月预见发作，从而为一分组再一就会发作的CRC症状获取一个评核新疗法的窗口。然而，这些ctDNA政治体制选项性下定义的MRD检验步骤的精确度仍然是极小的，迫切并不需要改进其检验机动性。

ctDNA的甲基转化成检验优于ctDNA的政治体制选项性检验。ctDNA的甲基转化成所致会在CRC里非常会类似于，并被视为大多数癌变的中期过渡阶段。这种甲基转化成，具体下定义为DNA里胞嘧啶的C5位置移除甲基基团，恒定周边地区性状的表远超，有数精华的抑癌性状失活。与政治体制选项性相比，CRC里发挥作用非常会多的甲基转化成所致会区域，为提升MRD检验的精确度获取了机就会。SEPT9，就是第一个并用血液检验单性状甲基转化成所致会顺利完成筛查和中期检验CRC的步骤。尽管ctDNA甲基转化成有这些优点，但这些相同的特点也并不需要谨慎，以保持检验归纳的选项性，并尽量减少假阳性的更有利于。

在这种历史背景下，Parikh和Taieb的这两项最新分析结果为我们对ctDNA机动性的理解获取了有用的补充，即无需原发有分组织，仅仅通过血液ctDNA甲基转化成或联合ctDNA选项性即可顺利完成准确的MRD评核。与其他并不需要对原发有分组织顺利完成高通量以导师全面性ctDNA归纳的检验并不相同，这两项分析探讨了Tumor-uninformed assays的有效性，它有几个优势，有数短时间的TAT，降低初始开发成本，对有分组织太低或不宜用的症状顺利完成追踪。

Parikh等人获取了一种ctDNA甲基转化成转转化成ctDNA政治体制选项性的通常会panel顺利完成MRD的归纳评核（NGS步骤），与其他零售业上可用的MRD检验步骤相比，这种步骤不并不需要手术的有分组织以及内置转化成。在再一病患后应用于于时，这种仅仅血液ctDNA-MRD检验对发作不具备诊断意义的选项性（100%）和精确度（55.6%），通过整合表观原核生物特点和横向追踪归纳，其精确度可颇更高至91%。1 该步骤被用于正在顺利完成的批判性分析，有数导师IIA期中风病患决策者的NRG协作分组分析（NCT04068103）。虽然还并不需要额之外的原始数据集来验证这些发现，但这些结果证明了基于ctDNA的MRD检验在不知情的情况下可不感兴趣的检验机动性特点。

Taieb等人的分析并用了一对先此前被证明是CRC手术后病症涉及的甲基转化成性状标示物WIF1和NPY（ddPCR步骤），并将它们应用于于PRODIGE-GERCOR IDEA-France次测试，将III期CRC症状随机分为3个同月 vs 6个同月的除此以外转化成疗。在对参加III期次测试的III期CRC症状顺利完成的首次ctDNA-MRD评核里，有13.8%的症状术后为ctDNA-MRD阳性，并被确认为独立的病症一个大。3 同时，分析者也指不止，与其他采用NGS步骤的ctDNA-MRD分析相比，本分析里ctDNA的阳性率很低。精确度和PPV比如说低于NGS检验结果，ctDNA-MRD阳性和阴性的5年DFS分别为65%和73%，尽管除此以外病患的和不理想的此前归纳结果显示处理有可能就会对这些结果产生不良影响。该步骤值得注意的是其相对于简单，非常会低的开发成本和潜在的遗忘性，不并不需要零售业检验里所见的专利检验步骤。正在顺利完成的批判性分析将有利于评核仅仅血液ctDNA检验有否都能准确评核MRD，以便对CRC症状顺利完成风险分层，并导师除此以外病患决策者。

无论采用何种步骤，仅仅用血液ctDNA-MRD检验来导师CRC症状的病患决定，并不需要可靠且准确的检验步骤。需颇更高仅仅血液ctDNA-MRD检验的精确度来确认哪些症状可以从病患降级里获益，以尽量避免不恰当地选项更高危症状不感兴趣很低强度的病患。Parikh及其同僚的分析结果表明，整合原核生物和表观原核生物以及横向血液追踪，可显著提升仅仅血液ctDNA-MRD的精确度。相比之下，ctDNA-MRD检验的更高选项性对于ctDNA作为一个原始的生物一个大来确认病患升级是至关极为重要的。由于选项性太低，假阳性的ctDNA-MRD有可能就会使症状不感兴趣可能会的强转化成病患。Parikh及其同僚的分析结果证明，除政治体制选项性之外，还可以通过转转化成表观原核生物甲基转化成特点的归纳来保持选项性。Taieb等人的归纳步骤的优势在于提升了诊断特点的精确度和病症，但是，正如分析者承认的那样，单独的两个性状甲基转化成标示有可能不能获取与转转化成政治体制选项性步骤的机动性特点。极为重要的是，这项临时工也强调了标准规范转化成归纳此前条件的极为重要性，因为各种提炼步骤可以在太大程度上不良影响ctDNA的得率和原始性。在预见的分析里，这些归纳此前的回避将变得更为极为重要。

甲基转化成被纳入MRD检验的潜力是完全一致的，渴望这些进展将之后提升新世代MRD检验的机动性。总之，仅仅血液ctDNA-MRD的检验获取了一个鲜明的机就会，应用于于一种无创步骤来聚焦病患方案，并有有可能造成危害更高危症状的凝转移性鳞状。这些分析结果无疑为预见ctDNA-MRD导师的批判性诊断次测试铺平了道路。

MRD，仍然是一个短时间的发展的课题，我们预计近两年有可能就会消失新的论据，要么结果显示不止MRD检验的诊断好处的局限性，要么结果显示不止MRD检验的其他优势和新用途。

参考资料：

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.